More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04752 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  88.1 
 
 		 210 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  80 
 
 		 210 aa  354  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  68.1 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  64.08 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  64.08 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  60.49 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  60.39 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  60.29 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  60.29 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  56.1 
 
 		 243 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  60.29 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  60.29 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  56.1 
 
 		 231 aa  250  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  59.8 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  51.94 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  51.94 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  46.34 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  48.53 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  46.83 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  46.34 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  46.34 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  48.06 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  46.31 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.83 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  45.37 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  45.37 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  46.83 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  49.51 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  44.34 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  52.43 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  48.28 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  48.28 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  43.2 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  43.94 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  41.67 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  45.03 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  40.49 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  41.18 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  41.27 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  40.2 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  40.2 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  39.71 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  40.2 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  39.71 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  42.27 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  39.02 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  38.03 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  41.18 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  43.85 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  38.31 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  40.69 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  38.62 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  40.69 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  40.69 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  38.62 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  44.09 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  44.09 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  44.09 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  44.09 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  44.09 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  43.55 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  40.69 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  37.27 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  37.79 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  36.82 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  37.7 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.23 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  35.52 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  36.22 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  35.52 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  34.41 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.65 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.79 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.36 
 
 		 181 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  33.03 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.87 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.77 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  31.68 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.47 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.09 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.18 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  26.29 
 
 		 303 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.17 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  32.78 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  33.33 
 
 		 753 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1386  class II aldolase/adducin-like  32.98 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.585457  normal  0.0870793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>