More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1177 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
264 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  51.63 
 
 
265 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  49.11 
 
 
234 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  45.89 
 
 
216 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  47.8 
 
 
214 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  45.85 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  43.4 
 
 
303 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  43.2 
 
 
214 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  43.19 
 
 
220 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  38.14 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  36.62 
 
 
215 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 
398 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  36.52 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  36.52 
 
 
235 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  37.08 
 
 
235 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  37.44 
 
 
227 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  36.1 
 
 
241 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  35.55 
 
 
214 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  35.41 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  32.69 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  36.62 
 
 
215 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  33.64 
 
 
221 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  36.08 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  33.03 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  33.18 
 
 
220 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  32.59 
 
 
226 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  33.48 
 
 
218 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  33.03 
 
 
224 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  32.27 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.03 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.55 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.58 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 
217 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.66 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  31.22 
 
 
228 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  32.7 
 
 
215 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  31.47 
 
 
428 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  31.4 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  33.02 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  31.11 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 
181 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 
212 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.99 
 
 
214 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  30.62 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 
213 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  30.53 
 
 
210 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  32.54 
 
 
222 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31 
 
 
222 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  32.27 
 
 
219 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  34.04 
 
 
427 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.59 
 
 
181 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
213 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  30.56 
 
 
243 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  32.18 
 
 
213 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  30.56 
 
 
231 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  32.18 
 
 
213 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  30.57 
 
 
210 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  33.14 
 
 
180 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  28.72 
 
 
212 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  31.6 
 
 
224 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  30.23 
 
 
222 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  28.72 
 
 
212 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  34.86 
 
 
190 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.86 
 
 
214 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 
185 aa  102  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  30.91 
 
 
216 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  30.91 
 
 
216 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 
239 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  30.28 
 
 
216 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  27.91 
 
 
217 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  33.84 
 
 
211 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  31.68 
 
 
213 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  32.54 
 
 
214 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  29.63 
 
 
212 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  30.6 
 
 
222 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  30.65 
 
 
210 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  28.9 
 
 
212 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  31.55 
 
 
215 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 
214 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  30.32 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  30.56 
 
 
220 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  28.44 
 
 
220 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  28.9 
 
 
214 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  28.44 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.55 
 
 
214 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>