More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1747 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
303 aa  630  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  42.56 
 
 
398 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  42.99 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  43.4 
 
 
264 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  41.46 
 
 
207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  37.98 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  41 
 
 
220 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  39.71 
 
 
214 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  36.36 
 
 
234 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  37.25 
 
 
214 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  37.3 
 
 
215 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.65 
 
 
225 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 
222 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  30.23 
 
 
227 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  34.03 
 
 
214 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
212 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  35.5 
 
 
219 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 
222 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.58 
 
 
225 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  33.03 
 
 
224 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.88 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  31.52 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  32.04 
 
 
428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  31.7 
 
 
221 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  32.44 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  32.81 
 
 
226 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  38.01 
 
 
189 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 
217 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  32.64 
 
 
218 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  31.96 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.48 
 
 
222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  32.12 
 
 
211 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.16 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  38.65 
 
 
185 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 
239 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  32.28 
 
 
216 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  34.07 
 
 
192 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 
266 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  32.28 
 
 
427 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.89 
 
 
222 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  31.65 
 
 
220 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.99 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  33.51 
 
 
753 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  30.57 
 
 
220 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  29.74 
 
 
211 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 
181 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  30.29 
 
 
216 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  30.88 
 
 
222 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  30.29 
 
 
216 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  29.26 
 
 
217 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  31.43 
 
 
215 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  34.57 
 
 
230 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.59 
 
 
181 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 
220 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  34.46 
 
 
180 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  35.54 
 
 
180 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  31.05 
 
 
212 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  31.05 
 
 
212 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.17 
 
 
220 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  32.28 
 
 
197 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  28.42 
 
 
214 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  31.8 
 
 
222 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.92 
 
 
214 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  30.21 
 
 
217 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  36.14 
 
 
190 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  30.14 
 
 
212 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  28.8 
 
 
231 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  30.14 
 
 
212 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  30.14 
 
 
212 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.8 
 
 
243 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  29.95 
 
 
212 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  29.19 
 
 
215 aa  99  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.72 
 
 
215 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  32.38 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  29.95 
 
 
212 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  28.99 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  26.92 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  29.63 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  34.03 
 
 
224 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  26.29 
 
 
215 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  28.77 
 
 
236 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  30.33 
 
 
215 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 
216 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  27.05 
 
 
210 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
188 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
237 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  29.47 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  26.89 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  30.16 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 
189 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>