More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2031 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  43.78 
 
 
222 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  43.88 
 
 
212 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  41.79 
 
 
219 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  41.75 
 
 
215 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  39.29 
 
 
217 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  38.27 
 
 
222 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  38.31 
 
 
237 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  39.9 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.2 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  35.9 
 
 
215 aa  139  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  37.06 
 
 
214 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  36.79 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40.21 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  40.64 
 
 
214 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 
213 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 
213 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 
213 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 
213 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  36.27 
 
 
213 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  38.07 
 
 
218 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 
213 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  38.07 
 
 
218 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  36.5 
 
 
223 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  38.31 
 
 
249 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  35.23 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  34.72 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  35.23 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.78 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  36.55 
 
 
212 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  38.14 
 
 
215 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  38.01 
 
 
212 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  35.32 
 
 
225 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  33.16 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.06 
 
 
216 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  35.55 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  37.31 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  37.31 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  38.31 
 
 
238 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  38.97 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  38.12 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  34.36 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.08 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  37.24 
 
 
753 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  35.9 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  36.87 
 
 
201 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
214 aa  124  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  34.52 
 
 
214 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.68 
 
 
214 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  39.23 
 
 
212 aa  124  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.37 
 
 
213 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 
230 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 
222 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.16 
 
 
238 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  36.22 
 
 
236 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.65 
 
 
231 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.67 
 
 
212 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  34.67 
 
 
214 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  34.67 
 
 
214 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  38.62 
 
 
215 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  36.6 
 
 
220 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
212 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  35.57 
 
 
216 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  36.92 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  34.65 
 
 
221 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.03 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  36.73 
 
 
227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  39.2 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  40.13 
 
 
220 aa  117  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31.58 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  35.57 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  38.46 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  32.99 
 
 
222 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.03 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  30.26 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  34.65 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  36.55 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  34.63 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  36.13 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  35.56 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  36 
 
 
229 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  35.53 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  35.56 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  33.01 
 
 
229 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  31.31 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  31.31 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  31.31 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  31.31 
 
 
215 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  30.81 
 
 
215 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  32.67 
 
 
219 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.03 
 
 
231 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  34.18 
 
 
218 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>