More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0319 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  100 
 
 
214 aa  440  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  43.2 
 
 
264 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  44.95 
 
 
207 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  44.5 
 
 
216 aa  188  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  44.88 
 
 
234 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  37.68 
 
 
265 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  40.3 
 
 
220 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  39.71 
 
 
303 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  36.23 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.98 
 
 
214 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  31.13 
 
 
214 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 
398 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  33.66 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  37.62 
 
 
220 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.63 
 
 
222 aa  127  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  35.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  39.41 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 
180 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  33.17 
 
 
235 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  35.38 
 
 
212 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.81 
 
 
214 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  32.14 
 
 
235 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  32.57 
 
 
235 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  34.92 
 
 
428 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.97 
 
 
212 aa  119  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.83 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 
215 aa  118  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
227 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  32.68 
 
 
427 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  32.54 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  39.31 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.18 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  36.61 
 
 
188 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  36.42 
 
 
180 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.56 
 
 
213 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.65 
 
 
239 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.53 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  32.62 
 
 
189 aa  111  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.15 
 
 
271 aa  108  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  33.87 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  31.32 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 
212 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  32.34 
 
 
215 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  29.7 
 
 
231 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  32.26 
 
 
231 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  32.26 
 
 
243 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  32.96 
 
 
224 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 
237 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  30.05 
 
 
214 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  31.66 
 
 
215 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.21 
 
 
212 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.21 
 
 
212 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  29.91 
 
 
222 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  32.66 
 
 
213 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  32.66 
 
 
213 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  32.66 
 
 
213 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.56 
 
 
215 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  29.95 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  34.55 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  29.95 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  32.5 
 
 
213 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  32.16 
 
 
213 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  32.32 
 
 
214 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  31.19 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  32.16 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  32.16 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  32.16 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  32.16 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  28.86 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  31.19 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  29.8 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.77 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  32.07 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  34.17 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  28.93 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  31 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  30.57 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  30.62 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  30.62 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  32.78 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  30.62 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  30.62 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  28.96 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  30.62 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  28.08 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  29.25 
 
 
220 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.52 
 
 
223 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  29.65 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  33.5 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  29.21 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>