More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2170 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  95.91 
 
 
220 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  87.91 
 
 
218 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  80.57 
 
 
212 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  79.52 
 
 
212 aa  348  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  80.38 
 
 
213 aa  347  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  82.78 
 
 
213 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  80.66 
 
 
213 aa  337  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  79.15 
 
 
212 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  79.15 
 
 
212 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  79.15 
 
 
212 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  81.82 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  81.82 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  81.82 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  81.82 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  81.82 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  79.05 
 
 
213 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  77.1 
 
 
214 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  75.36 
 
 
212 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  75.23 
 
 
214 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  73.93 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  68.98 
 
 
217 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  76.19 
 
 
212 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  75.24 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  57.21 
 
 
222 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  53.33 
 
 
224 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  52.89 
 
 
224 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  50 
 
 
220 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  50.7 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.72 
 
 
222 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  50.24 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  52.06 
 
 
225 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  49.05 
 
 
226 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  49.3 
 
 
220 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  51.03 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  49.28 
 
 
221 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  47.39 
 
 
220 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  46.86 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  50 
 
 
211 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  47.85 
 
 
218 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  43.68 
 
 
231 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  46.35 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  42.16 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  45 
 
 
218 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  44.44 
 
 
210 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  45.83 
 
 
217 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  44.44 
 
 
210 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  43.96 
 
 
224 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  45.03 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  40.2 
 
 
215 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  42.19 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  41.78 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  43.17 
 
 
210 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  44.5 
 
 
212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  44.5 
 
 
212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  44.5 
 
 
212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  44.5 
 
 
212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  43.98 
 
 
212 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  40.54 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  43.78 
 
 
208 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  43.78 
 
 
208 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  41.03 
 
 
226 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  39.02 
 
 
220 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  41.86 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  37.43 
 
 
216 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  36.31 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.89 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.44 
 
 
264 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  33.93 
 
 
180 aa  99.8  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  34.41 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  31.67 
 
 
398 aa  98.2  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  31.79 
 
 
180 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 
190 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  30.94 
 
 
265 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.94 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.04 
 
 
303 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.42 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  30.2 
 
 
220 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.55 
 
 
181 aa  89  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  31.92 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  27.78 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 
324 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  33.82 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  35.45 
 
 
332 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  29.53 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.29 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  28.84 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  28.84 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  28.84 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>