More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4650 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  93.15 
 
 
218 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  86.92 
 
 
224 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  84.16 
 
 
222 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  83.64 
 
 
220 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  85.32 
 
 
226 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  83.64 
 
 
228 aa  367  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  83.11 
 
 
225 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  79.45 
 
 
220 aa  361  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  78.04 
 
 
220 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  77.73 
 
 
211 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  60.1 
 
 
216 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  61.43 
 
 
219 aa  248  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  58.29 
 
 
220 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  59.9 
 
 
217 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  50.24 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  50.24 
 
 
231 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  50.79 
 
 
217 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  54.26 
 
 
212 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  50.95 
 
 
224 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  46.83 
 
 
215 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  50.48 
 
 
210 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  49.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  49.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  49.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  49.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  48.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  49.03 
 
 
212 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  49.06 
 
 
210 aa  191  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  46.34 
 
 
210 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  49.28 
 
 
218 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  46.57 
 
 
218 aa  187  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  46.57 
 
 
218 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  50 
 
 
220 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  49.28 
 
 
214 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  49.28 
 
 
220 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  45.85 
 
 
210 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  48.33 
 
 
214 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  50.98 
 
 
226 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  46.08 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  47.34 
 
 
212 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  47.34 
 
 
212 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  47.12 
 
 
212 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  53.11 
 
 
209 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  46.88 
 
 
224 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  45.54 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  47.06 
 
 
222 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  45.67 
 
 
212 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 
208 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  46.63 
 
 
213 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  50.25 
 
 
208 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  45.67 
 
 
212 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  47.6 
 
 
213 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  51.08 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  46.63 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  46.63 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  46.63 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  46.63 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  47.74 
 
 
204 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  44.5 
 
 
216 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  43.07 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 
264 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.7 
 
 
303 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  35.85 
 
 
214 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  34.31 
 
 
207 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.73 
 
 
216 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  35.41 
 
 
215 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  35.52 
 
 
181 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.69 
 
 
219 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  34.04 
 
 
190 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 
227 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 
180 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.44 
 
 
216 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  29.22 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  34.86 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.38 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.72 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  32.7 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  32.11 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  32.09 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  29.33 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  35.64 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  33.81 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  28.92 
 
 
398 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.8 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  31.71 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>