More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1553 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  100 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  62.15 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  64.29 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  61.14 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  60.66 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  63.33 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  60.66 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  61.68 
 
 		 220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  59.24 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  61.06 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  60.1 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  59.13 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  55.78 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  49.06 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  48.82 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  45.19 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  45.19 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  44.95 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  42.36 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  42.36 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  48.02 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  51.22 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  44.86 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  41.67 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  48.5 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  48.06 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  46.24 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  48.06 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  42 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  44 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  42.5 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  41.58 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  45.79 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  44.29 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  45.79 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  44.29 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  44.44 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  42.99 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  43.96 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  43.19 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  46.84 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  45.45 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  43.6 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  41.78 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  42.72 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  40.69 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  42.06 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  41.12 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.99 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.99 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.99 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  43.13 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  41.12 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  39.65 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  38.74 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  38.67 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  37.38 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  32.12 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30.39 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  34.91 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 265 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  31.1 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  31.15 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  32.69 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.8 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.66 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  27.96 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  30.05 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  28.5 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  26.79 
 
 		 428 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  29.67 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  30.2 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  28.71 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  28.99 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  28.71 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  34.34 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  28.37 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  32.71 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.29 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  30 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>