299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3411 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  95.33 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  78.2 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  77.25 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  78.2 
 
 		 212 aa  328  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  74.41 
 
 		 218 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  76.56 
 
 		 212 aa  324  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  75.23 
 
 		 220 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  74.77 
 
 		 220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  70.37 
 
 		 217 aa  314  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  77.99 
 
 		 213 aa  313  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  75.6 
 
 		 213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  75.6 
 
 		 213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  75.6 
 
 		 213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  75.6 
 
 		 213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  75.6 
 
 		 213 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  73.58 
 
 		 213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  75.12 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  72.73 
 
 		 212 aa  298  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  72.73 
 
 		 212 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  69.19 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  58.82 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  56.44 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  56.19 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  50.48 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  49.76 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  50.72 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  49.76 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.98 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  50 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  48.11 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  51.2 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  47.83 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  47.6 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.39 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  48.33 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  48.8 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  47.85 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  46.63 
 
 		 210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  42.31 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  42.31 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  46.15 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  45.45 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  43.9 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  47.32 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  42.93 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  45.67 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  45.67 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  45.67 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  45.67 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  45.67 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  43.19 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  39.02 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  39.51 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  38.05 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  37.75 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  43.32 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  41.58 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  41.79 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  44.25 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  36.27 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  37.06 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  37.57 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.9 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.88 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.44 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.72 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.36 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.59 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  34.72 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  27.05 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  48.18 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  28.89 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  31.75 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  26.44 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  29.94 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  31.75 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  29 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  27.96 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.46 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  31.94 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  29.91 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  27.89 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  29.86 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>