More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2810 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
332 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  64.46 
 
 
332 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  58.87 
 
 
385 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  48.77 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  42.94 
 
 
323 aa  225  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  56.06 
 
 
138 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  50.54 
 
 
213 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  55.3 
 
 
140 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  54.89 
 
 
138 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  54.55 
 
 
140 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.1 
 
 
181 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.86 
 
 
144 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  37.3 
 
 
215 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  35 
 
 
398 aa  95.9  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 
190 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  36.67 
 
 
207 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.68 
 
 
180 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  33.93 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  35.52 
 
 
189 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  38.01 
 
 
220 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  30.64 
 
 
181 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32.43 
 
 
210 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  35.2 
 
 
231 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  37.65 
 
 
208 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  35.2 
 
 
243 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  37.28 
 
 
212 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  37.57 
 
 
225 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  37.65 
 
 
208 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  34.08 
 
 
214 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  36.69 
 
 
212 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  28.41 
 
 
180 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 
214 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.69 
 
 
234 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  36.17 
 
 
220 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  31.91 
 
 
210 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  35.43 
 
 
235 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  34.05 
 
 
211 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  36.42 
 
 
217 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  35.64 
 
 
218 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  35.45 
 
 
220 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  33.89 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  33.15 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  33.15 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.66 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  33.89 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  35.29 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  33.15 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 
235 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  37.57 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  33.14 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  33.15 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  36.19 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  38.35 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  33.15 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  34.82 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  38.35 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  44.8 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  32.61 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  32.61 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  32.61 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.61 
 
 
222 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  32.61 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  34.29 
 
 
127 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  33.89 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  32.61 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  34.44 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  33.71 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  33.92 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  35 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  35.79 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  32.6 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  39.53 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  30.99 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.09 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  39.57 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  32.43 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  34.25 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  26.84 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.04 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  35.03 
 
 
204 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  31.89 
 
 
218 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  33.71 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  38.76 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  35.11 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  35.11 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  31.35 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  36.14 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>