200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1471 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  254  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  85.83 
 
 
127 aa  221  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  84.25 
 
 
127 aa  219  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  77.95 
 
 
127 aa  203  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  58.12 
 
 
123 aa  142  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.32 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  40.95 
 
 
138 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  37.14 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  37.14 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  36.11 
 
 
332 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  37.5 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  37.17 
 
 
385 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.13 
 
 
311 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  34.82 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.63 
 
 
323 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.18 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  33.61 
 
 
321 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.79 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  35.35 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.68 
 
 
265 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  36.7 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.73 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  36.28 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  34.4 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  33.04 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  33.04 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  39.05 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.54 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  31.2 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.79 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  32.77 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  33.04 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  33.68 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  32.99 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  36.19 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  37.11 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  30.95 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  37.08 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.28 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  32.99 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  32.74 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  31.82 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  32.69 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  33.65 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  36.28 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  35.45 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  31.78 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.19 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  32.35 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  37.37 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  35.05 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  34.31 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  33.65 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  36.61 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  36.61 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  32.99 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.45 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  35.14 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  31.78 
 
 
272 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  31.19 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  31.21 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.96 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  35.05 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35.05 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  30.93 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.91 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  36.13 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  30.3 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  33.65 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  32.69 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  35.4 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  35.51 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  34.95 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  30.39 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.86 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  32.99 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  34.02 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  51.85 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.61 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  36.61 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  29.9 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  29.81 
 
 
129 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  36.61 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  34.55 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>