208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5557 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  85.19 
 
 		 162 aa  283  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  70.7 
 
 		 167 aa  237  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  71.97 
 
 		 168 aa  236  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  71.97 
 
 		 178 aa  236  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  69.23 
 
 		 165 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  59.57 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  55.13 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  54.55 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  51.41 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  54.89 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  50.34 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  46.53 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  48.98 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  49.62 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  48.55 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  49.31 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  43.87 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  52.17 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  48.94 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  47.83 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  47.83 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  49.31 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  48.61 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  43.07 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.97 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  44.7 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  41.6 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  43.97 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.54 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  47.01 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  40.71 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  38.03 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  43.07 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  43.07 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  44.03 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  41.04 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.72 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  42.54 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  40.94 
 
 		 141 aa  97.1  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.56 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  40.3 
 
 		 294 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  41.13 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.56 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.14 
 
 		 311 aa  94.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  37.96 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  41.04 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40.79 
 
 		 241 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.3 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  42.03 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  41.35 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  37.7 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  34.56 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  36.43 
 
 		 332 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  37.4 
 
 		 272 aa  85.5  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  46.02 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.82 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  38.66 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.17 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  34.75 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  37.31 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  32.89 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  41.09 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  45.37 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  39.55 
 
 		 385 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  39.32 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  32.89 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  39.53 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  38.06 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  40.18 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  37.75 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  37.6 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  38.84 
 
 		 324 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  35.78 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  39.66 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  40.57 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  37.76 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.81 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  37.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  34.72 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  34.01 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  32.89 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>