207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0563 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  64.79 
 
 		 176 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  60 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  60.56 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  59.03 
 
 		 162 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  56.85 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  56.43 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  56.43 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  57.86 
 
 		 174 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  53.57 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  53.57 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  57.86 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  55.94 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  53.85 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  51.41 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  52.17 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  50.7 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  49.3 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  50.7 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  48.92 
 
 		 162 aa  137  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  47.26 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  50.42 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  44.54 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  42.02 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  42.02 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.34 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  40.34 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.83 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.5 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  37.9 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.84 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.16 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.06 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.59 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.34 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  33.88 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  45.83 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40.44 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.72 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  41.28 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  76.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  40.65 
 
 		 265 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.96 
 
 		 205 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  38.71 
 
 		 272 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  35.54 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  39.23 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  40.3 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  38.33 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  42.2 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.1 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  44.79 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  37.23 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  35.71 
 
 		 244 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.97 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  39.33 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  40.45 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  35.83 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  34.29 
 
 		 244 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36.15 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  40.45 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  36.22 
 
 		 332 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  34.53 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  35.83 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  39.8 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  35.29 
 
 		 294 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  38 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.88 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  44.12 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.92 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  33.57 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.6 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  33.57 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  35.14 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.5 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  33.57 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  37.4 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.74 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>