208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1018 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
171 aa  336  9e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  60.12 
 
 
166 aa  200  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  49.06 
 
 
160 aa  157  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  47.83 
 
 
167 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  48.1 
 
 
164 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  46.71 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  48.37 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  48.41 
 
 
183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.94 
 
 
294 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  47.13 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40.24 
 
 
164 aa  137  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  51.08 
 
 
167 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  47.53 
 
 
175 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  45.28 
 
 
161 aa  134  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  44.79 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  46.84 
 
 
167 aa  124  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.28 
 
 
163 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40.14 
 
 
155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  39.86 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  43.26 
 
 
155 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  43.36 
 
 
166 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
205 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  35.37 
 
 
161 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  36.5 
 
 
145 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  98.6  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  38.56 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.28 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  39.75 
 
 
336 aa  94.7  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  94.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  41.04 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  94.4  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  39.07 
 
 
182 aa  94  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  37.84 
 
 
172 aa  94  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  36.25 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.44 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  35.37 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  37.11 
 
 
230 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.92 
 
 
151 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  42.18 
 
 
231 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  43.51 
 
 
231 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  37.11 
 
 
232 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.27 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.06 
 
 
241 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  41.98 
 
 
231 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.11 
 
 
240 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  32.28 
 
 
135 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  34.09 
 
 
231 aa  87.8  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  40.74 
 
 
239 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 
167 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  36.09 
 
 
244 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  36.09 
 
 
244 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40.77 
 
 
234 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.04 
 
 
138 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.77 
 
 
230 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.35 
 
 
165 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  43.38 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  35.34 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  42.24 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  36.92 
 
 
244 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.03 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  35.29 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  37.33 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  37.3 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  33.92 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  32.84 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 
129 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.15 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  41.1 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.51 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  38.06 
 
 
272 aa  79  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  40.71 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  36.13 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  33.81 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  32.19 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  34.33 
 
 
245 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  31.76 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  32.84 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  36.91 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  33.58 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  37.72 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  33.77 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  30.43 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  28.06 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  36.97 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  32.61 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  37.1 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  33.85 
 
 
271 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>