207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4082 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
166 aa  336  9e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  60.12 
 
 
171 aa  200  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  49.06 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  48.37 
 
 
160 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 
175 aa  160  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  48.45 
 
 
167 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  45.78 
 
 
166 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  49.67 
 
 
183 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  47.1 
 
 
161 aa  151  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.23 
 
 
294 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  43.23 
 
 
164 aa  149  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  47.13 
 
 
164 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  48.7 
 
 
162 aa  147  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  46.79 
 
 
167 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  48.25 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  40.91 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.38 
 
 
163 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.31 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  40.85 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  38.3 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  38.57 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.24 
 
 
150 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  107  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.42 
 
 
205 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  36.46 
 
 
241 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  37.84 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  35.98 
 
 
235 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  37.84 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.16 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.16 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  41.13 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  36.54 
 
 
230 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  42.45 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  35 
 
 
239 aa  94  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.43 
 
 
311 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  35 
 
 
230 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  36.91 
 
 
230 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  34.38 
 
 
232 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  40.94 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40 
 
 
237 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  39.29 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  36.24 
 
 
235 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  42.52 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  38.16 
 
 
336 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  41.13 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  33.14 
 
 
248 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  38.13 
 
 
231 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  36.24 
 
 
235 aa  89  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  41.73 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  39.68 
 
 
131 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  37.96 
 
 
234 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  35.57 
 
 
235 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  35.57 
 
 
246 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  35.57 
 
 
246 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  35.57 
 
 
246 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  35.57 
 
 
246 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  35.86 
 
 
235 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  34.44 
 
 
251 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  36.91 
 
 
238 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.57 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  39.2 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  38.67 
 
 
286 aa  85.5  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
235 aa  85.1  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  37.67 
 
 
233 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.01 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.45 
 
 
135 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.57 
 
 
238 aa  84.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  37.58 
 
 
235 aa  84  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  41.46 
 
 
153 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  35.1 
 
 
239 aa  84  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  35.94 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  37.12 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  39.69 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.16 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.61 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  33.57 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  33.1 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  33.79 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  35.57 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  34.48 
 
 
245 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  34.81 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  32.41 
 
 
256 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  33.77 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  32.91 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>