208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  78.7 
 
 
239 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  76.09 
 
 
235 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  78.85 
 
 
231 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  78.6 
 
 
231 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  78.26 
 
 
230 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  76.96 
 
 
230 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  76.21 
 
 
234 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  77.09 
 
 
231 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  77.19 
 
 
232 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  76.32 
 
 
230 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  47.88 
 
 
256 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  50.23 
 
 
240 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  48.85 
 
 
241 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  45.98 
 
 
239 aa  204  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  53.46 
 
 
251 aa  201  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  51.8 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  47.46 
 
 
245 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  45.53 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  46.15 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  44.31 
 
 
262 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  47.47 
 
 
231 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  50.68 
 
 
238 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  50.23 
 
 
238 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  48.36 
 
 
251 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  45.91 
 
 
244 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  44.7 
 
 
234 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  47.58 
 
 
235 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  47.49 
 
 
235 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  44.17 
 
 
244 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  44.17 
 
 
244 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  44.17 
 
 
244 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  47.49 
 
 
235 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  45.7 
 
 
244 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  45.7 
 
 
244 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  43.38 
 
 
232 aa  185  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  43.33 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  49.35 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  47.03 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  46.61 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  45.37 
 
 
235 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  44.4 
 
 
248 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  44.59 
 
 
246 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  44.59 
 
 
246 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  44.59 
 
 
246 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  44.59 
 
 
246 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  47.17 
 
 
235 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  47.17 
 
 
235 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  47.17 
 
 
235 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  47.89 
 
 
235 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.32 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  44.19 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  45.54 
 
 
235 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  45.58 
 
 
238 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  42.41 
 
 
240 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  39.81 
 
 
239 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  38.82 
 
 
249 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
228 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  41.59 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  33.58 
 
 
280 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  34.19 
 
 
280 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  40.17 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  37.65 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  41.46 
 
 
336 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  45.45 
 
 
142 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  47.55 
 
 
172 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  42.54 
 
 
135 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  46.15 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  45.1 
 
 
172 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  45.45 
 
 
182 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  41.01 
 
 
163 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  42.96 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  42.11 
 
 
294 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  36.52 
 
 
286 aa  95.5  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.14 
 
 
145 aa  95.5  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  38.18 
 
 
166 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  41.96 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  38.97 
 
 
164 aa  92  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  41.35 
 
 
160 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.64 
 
 
155 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  39.63 
 
 
167 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  42.86 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  37.66 
 
 
183 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  89.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  89.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  42.11 
 
 
171 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  41.3 
 
 
166 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.16 
 
 
155 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.69 
 
 
167 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  31.58 
 
 
181 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.35 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  37.59 
 
 
142 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>