208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0989 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  56.58 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  53.55 
 
 		 183 aa  180  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  49.68 
 
 		 294 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  55.41 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  50.64 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  51.55 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  51.27 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  46.84 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  47.77 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  45.1 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  50.62 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  45.86 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  43.23 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  47.22 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  47.18 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  47.48 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  47.48 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  40.24 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  42.58 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  45.58 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.76 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  44.06 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.36 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  42.97 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  39.22 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.82 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  38.56 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.17 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.06 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  42.03 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  45.24 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40 
 
 		 237 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  41.43 
 
 		 239 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.57 
 
 		 311 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  40.14 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  43.18 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.32 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  43.18 
 
 		 232 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  39.68 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  40.74 
 
 		 272 aa  97.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  41.79 
 
 		 230 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  34.44 
 
 		 241 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  42.42 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  39.58 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  38.57 
 
 		 248 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  49.02 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  38.46 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  40.88 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  40.58 
 
 		 235 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  38.26 
 
 		 238 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40.58 
 
 		 231 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  40.62 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  37.18 
 
 		 251 aa  95.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.04 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  38.69 
 
 		 235 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  34.56 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.42 
 
 		 205 aa  94.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40.6 
 
 		 234 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  41.91 
 
 		 265 aa  94.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  34.81 
 
 		 251 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  34.21 
 
 		 235 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  34.21 
 
 		 235 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  43.51 
 
 		 271 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  37.58 
 
 		 238 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  34.21 
 
 		 235 aa  94  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  43.69 
 
 		 139 aa  94  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  40.13 
 
 		 244 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  40.13 
 
 		 244 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  37.66 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  42.96 
 
 		 244 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  36.99 
 
 		 241 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  40.71 
 
 		 262 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  42.64 
 
 		 265 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  36.6 
 
 		 238 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  34.87 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.97 
 
 		 240 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  34.56 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  43.38 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  38.51 
 
 		 231 aa  91.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  44.35 
 
 		 147 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  38.89 
 
 		 245 aa  91.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  42.96 
 
 		 244 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  42.22 
 
 		 244 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  42.22 
 
 		 244 aa  90.9  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  38.16 
 
 		 249 aa  90.9  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  42.22 
 
 		 244 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  38.51 
 
 		 232 aa  90.5  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  42.22 
 
 		 244 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>