206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0281 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  89.36 
 
 
235 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  89.36 
 
 
235 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  89.36 
 
 
235 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  89.36 
 
 
235 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  84.68 
 
 
235 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  71.49 
 
 
235 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  70.21 
 
 
235 aa  348  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  70.21 
 
 
235 aa  348  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  70.21 
 
 
235 aa  347  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  70.82 
 
 
235 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  69.23 
 
 
238 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  68.38 
 
 
238 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  66.09 
 
 
235 aa  329  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  52.14 
 
 
238 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  54.5 
 
 
241 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  50.43 
 
 
265 aa  248  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  50.22 
 
 
240 aa  247  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  51.08 
 
 
245 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  52.16 
 
 
234 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  49.15 
 
 
256 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  52.16 
 
 
231 aa  241  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  48.72 
 
 
262 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  49.78 
 
 
232 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  50.65 
 
 
231 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  50.45 
 
 
240 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  48.52 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  48.74 
 
 
245 aa  234  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  47 
 
 
249 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  49.56 
 
 
237 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  49.32 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  49.32 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  49.09 
 
 
244 aa  221  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  49.09 
 
 
244 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  48.64 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  48.86 
 
 
244 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  48.86 
 
 
244 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  42.55 
 
 
239 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  42.67 
 
 
239 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  50.89 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.25 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  47.27 
 
 
235 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  47.66 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  46.67 
 
 
230 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  48.83 
 
 
231 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  47.66 
 
 
230 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  46.95 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  44.54 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.56 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  44.59 
 
 
240 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  49.3 
 
 
231 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  41.26 
 
 
233 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  46.95 
 
 
231 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  44.75 
 
 
234 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  40.35 
 
 
233 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.57 
 
 
231 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  35.55 
 
 
280 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  35.11 
 
 
280 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  37.71 
 
 
263 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  39.29 
 
 
196 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.51 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.88 
 
 
182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  42.66 
 
 
142 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  36.53 
 
 
336 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  38.46 
 
 
183 aa  99  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  30.12 
 
 
286 aa  99  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  35.62 
 
 
155 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.16 
 
 
145 aa  96.3  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
164 aa  95.9  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 
164 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 
175 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  34.64 
 
 
167 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.86 
 
 
161 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  35.57 
 
 
166 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.97 
 
 
160 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.23 
 
 
162 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  32.72 
 
 
183 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  33.78 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.33 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  31.79 
 
 
163 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  30.38 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  33.54 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  35.88 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  33.97 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.68 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>