207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2065 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  49.35 
 
 
237 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  45.38 
 
 
262 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  45.76 
 
 
256 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  45.26 
 
 
240 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  53.24 
 
 
231 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  44.02 
 
 
245 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  44.49 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  43.97 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  45.76 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  44.54 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  52.31 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  44.05 
 
 
235 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  43.81 
 
 
235 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  44.05 
 
 
235 aa  197  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  44.25 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  44.25 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  44.25 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  44.25 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  44.25 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  45 
 
 
244 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  45 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  44.12 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  43.72 
 
 
238 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  43.86 
 
 
241 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  42.8 
 
 
235 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  43.1 
 
 
244 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  45.45 
 
 
244 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  43.42 
 
 
235 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  45.58 
 
 
231 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 
235 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  44.55 
 
 
244 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  44.55 
 
 
244 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  50.93 
 
 
230 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  40.97 
 
 
238 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  42.92 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  48.61 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  43.1 
 
 
244 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  42.86 
 
 
248 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  44.75 
 
 
244 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  48.47 
 
 
234 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  185  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  49.54 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  40.69 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  49.35 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  41.7 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  47.73 
 
 
230 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  40.09 
 
 
239 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  46.82 
 
 
230 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  46.82 
 
 
232 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  47.39 
 
 
231 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  38.98 
 
 
234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  39.91 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  46.82 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  44.5 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  39.06 
 
 
231 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  39.81 
 
 
249 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  40.34 
 
 
231 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  39.46 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.94 
 
 
228 aa  158  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  36.25 
 
 
280 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  39.04 
 
 
263 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  34.8 
 
 
280 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  42.04 
 
 
172 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  45.33 
 
 
182 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  32.95 
 
 
286 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  43.33 
 
 
196 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  43.31 
 
 
183 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  40 
 
 
336 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  43.33 
 
 
172 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  36.46 
 
 
166 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  40.56 
 
 
142 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.86 
 
 
167 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  42.18 
 
 
294 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.6 
 
 
160 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  46.67 
 
 
162 aa  99.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  40.51 
 
 
175 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.44 
 
 
164 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  40.82 
 
 
166 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  44.03 
 
 
162 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  42.57 
 
 
165 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.97 
 
 
164 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  41.45 
 
 
167 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  32.35 
 
 
181 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  40.79 
 
 
162 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.33 
 
 
151 aa  92  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  47.24 
 
 
176 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  41.38 
 
 
168 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  44.06 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>