204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1347 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  97.95 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  96.31 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  94.26 
 
 		 244 aa  483  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  94.67 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  89.75 
 
 		 244 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  90.16 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  78.33 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  76.45 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  75.31 
 
 		 245 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  73.88 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  72.73 
 
 		 240 aa  350  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  73.97 
 
 		 241 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  75 
 
 		 245 aa  348  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  56.22 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  53.18 
 
 		 234 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  53.74 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  51.98 
 
 		 232 aa  235  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  50.45 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  52.8 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  49.37 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  50.45 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  47.72 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  50.22 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  50.23 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  47.56 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  52.78 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  49.3 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  48.64 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  42.74 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  47.01 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  47.3 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  47.14 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  47.73 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  45.19 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  45.57 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  44.87 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  47.27 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  44.05 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  44.77 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  46.36 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  43.1 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  47.27 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  46.61 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  46.67 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  43.81 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  44.26 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  40.83 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  46.08 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  36.93 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  35.56 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  39.26 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.42 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  39.39 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.25 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.59 
 
 		 172 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  43.45 
 
 		 142 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  33.47 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40.28 
 
 		 167 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 		 164 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  40.14 
 
 		 163 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.86 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.76 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  35.34 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  34.42 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.32 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.01 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  36.15 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.73 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  38.94 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  35.48 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.68 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  32.67 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.57 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35.97 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.98 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>