208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2344 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  45.58 
 
 
241 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  44.26 
 
 
240 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  45.29 
 
 
228 aa  186  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  42.92 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  41.6 
 
 
238 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  42.74 
 
 
235 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  42.17 
 
 
265 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  41.95 
 
 
235 aa  174  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  41.03 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  39.08 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  42.99 
 
 
244 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  39.57 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  40.93 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  37.39 
 
 
231 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  41.88 
 
 
238 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  40.17 
 
 
235 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 
235 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  39.57 
 
 
235 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  40.51 
 
 
238 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  38.66 
 
 
235 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  41.03 
 
 
256 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  38.79 
 
 
234 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  41.77 
 
 
244 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  38.24 
 
 
235 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 
233 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  39.15 
 
 
246 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  42.15 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  39.13 
 
 
245 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  40.83 
 
 
244 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  41.96 
 
 
244 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  41.35 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  40.27 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  41.35 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  40.51 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.22 
 
 
237 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  38.14 
 
 
232 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.81 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  42.13 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  37.18 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  38.33 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  37.71 
 
 
248 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  38.03 
 
 
251 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  43.72 
 
 
231 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  41.59 
 
 
240 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.35 
 
 
230 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  40.79 
 
 
239 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  38.91 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  42.25 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  41.78 
 
 
232 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  42.4 
 
 
251 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  42.33 
 
 
230 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  39.47 
 
 
234 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  41.59 
 
 
231 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.59 
 
 
231 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  38.24 
 
 
239 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  37.55 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  40.31 
 
 
280 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  32.03 
 
 
239 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  39.89 
 
 
280 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  41.67 
 
 
142 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  35.12 
 
 
336 aa  98.6  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  37.36 
 
 
286 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  35.85 
 
 
172 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.33 
 
 
145 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  36.08 
 
 
196 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  88.6  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
155 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  34.09 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.75 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.33 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.51 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.1 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  33.74 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.16 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  34.64 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.21 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.7 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  28.05 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  32.03 
 
 
175 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.83 
 
 
135 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  31.95 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  31.45 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  29.17 
 
 
161 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>