208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0552 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  60.78 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  54.14 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  54.25 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  52.26 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  57.05 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  48.72 
 
 		 294 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  50.64 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  45.86 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  52.5 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  48.7 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  47.71 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  45.86 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  48.72 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  47.13 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  41.78 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  43.66 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  42.28 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40.97 
 
 		 143 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40.97 
 
 		 143 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  43.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45.32 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  43.05 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  40.14 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  42.74 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  46.09 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  44.03 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  41.4 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  44.03 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  41.5 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  41.78 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  43.07 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  46.67 
 
 		 241 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.16 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  46.22 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  33.57 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.72 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  39.26 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  37.96 
 
 		 235 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  42.96 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  42.86 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  37.84 
 
 		 238 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  42.96 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  43.38 
 
 		 231 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  37.65 
 
 		 235 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  41.91 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  39.39 
 
 		 238 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  37.65 
 
 		 235 aa  88.6  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  37.65 
 
 		 235 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  87.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  39.71 
 
 		 245 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  39.71 
 
 		 228 aa  86.3  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  36.18 
 
 		 240 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  39.84 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  41.48 
 
 		 234 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  33.94 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  38.64 
 
 		 248 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  35.77 
 
 		 251 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  36.6 
 
 		 240 aa  85.5  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  39.37 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  42.62 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  39.39 
 
 		 231 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  37.18 
 
 		 233 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40.98 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  37.78 
 
 		 265 aa  84.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  37.33 
 
 		 235 aa  84.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  30.9 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 234 aa  84  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  84  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  39.71 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  36.76 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  41.22 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  37.16 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  39.06 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>