208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2483 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  63.64 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  60.13 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  59.87 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  53.46 
 
 		 294 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  56.6 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  51.55 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  52.5 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  57.05 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  49.36 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  53.46 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  52.2 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  49.68 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  47.53 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  43.95 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  47.86 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.57 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  47.86 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  44.67 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.6 
 
 		 143 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.6 
 
 		 143 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  44.67 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  44.08 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  44.2 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.56 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40.44 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  41.27 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.86 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.86 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  45.86 
 
 		 230 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  42.54 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  44.78 
 
 		 231 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  44.78 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40.51 
 
 		 241 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  40.49 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  41.1 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  44.78 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.22 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  47.66 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  41.96 
 
 		 240 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.41 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  42.65 
 
 		 234 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  36.18 
 
 		 238 aa  90.9  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.09 
 
 		 265 aa  90.9  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.18 
 
 		 237 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  37.84 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  37.09 
 
 		 251 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  37.41 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.53 
 
 		 238 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  31.76 
 
 		 238 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  42.65 
 
 		 230 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  88.2  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.84 
 
 		 138 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  41.35 
 
 		 272 aa  87.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38 
 
 		 251 aa  87.4  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  38.41 
 
 		 245 aa  87.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  38.1 
 
 		 248 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  41.18 
 
 		 239 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  35.53 
 
 		 235 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  32.2 
 
 		 235 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  44.95 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  37.24 
 
 		 240 aa  84.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  43.12 
 
 		 142 aa  84.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 271 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  35.53 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  36.05 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  36.3 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  36.42 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  43 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  37.68 
 
 		 256 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  33.78 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  37.68 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  39.53 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  36.3 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.35 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  32.64 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  31.91 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  37.6 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>