207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2292 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  52.09 
 
 		 271 aa  284  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  39.81 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  45.59 
 
 		 138 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.74 
 
 		 144 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.31 
 
 		 143 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.31 
 
 		 143 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.51 
 
 		 151 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.33 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.06 
 
 		 167 aa  95.5  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  93.2  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.64 
 
 		 164 aa  92.8  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  38.46 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  44.53 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  41.32 
 
 		 139 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  41.79 
 
 		 151 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  37.09 
 
 		 175 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.27 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  43.08 
 
 		 160 aa  90.1  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  39.24 
 
 		 230 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 		 135 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  39.87 
 
 		 232 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  43.51 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  43.75 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  36.72 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  38.69 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.35 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  36.42 
 
 		 230 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.75 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  39.86 
 
 		 164 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  40.29 
 
 		 159 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  39.23 
 
 		 162 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  38.76 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  36.72 
 
 		 131 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.8 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  37.78 
 
 		 141 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  36.72 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  40.16 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  34.36 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  42.19 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  37.12 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  35.94 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  36.78 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  35.94 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  34.96 
 
 		 157 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  34.96 
 
 		 157 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  36.09 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  34.19 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  43.81 
 
 		 158 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  29.53 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  35.56 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  38.21 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  37.9 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.92 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.35 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  40.43 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  40.58 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  38.68 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  40.65 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  36.51 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  39.53 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.51 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  41.05 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  39.82 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  45.1 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  34.51 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  32 
 
 		 167 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  35.38 
 
 		 142 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  34.4 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  39.06 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>