207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0682 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 167 aa  339  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  91.62 
 
 		 168 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  91.02 
 
 		 178 aa  309  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  70.7 
 
 		 162 aa  237  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  68.55 
 
 		 165 aa  230  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  67.52 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  55.17 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  56.03 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  48.39 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  49.37 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  47.89 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  51.39 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  47.22 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  49.3 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  48.61 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  51.09 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  47.92 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  48.91 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  51.09 
 
 		 153 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  47.33 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  46.9 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.29 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  46.21 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.51 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.51 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.76 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  40.32 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  39.52 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.15 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  43.44 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40 
 
 		 311 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.35 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.37 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  37.12 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  38.93 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  38.58 
 
 		 332 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.45 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.39 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  40.94 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  39.42 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.13 
 
 		 144 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  36.72 
 
 		 272 aa  88.6  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  46.23 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.06 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  33.1 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 		 271 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  33.83 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.21 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  35.67 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  32.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.01 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  37.3 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  48.08 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.72 
 
 		 323 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  32.06 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  31.91 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  44.12 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  36.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  31.82 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  31.2 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  29.17 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  37.74 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  35.83 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  37.09 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.19 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  33.91 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  31.88 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  34.72 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.43 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.57 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  36.63 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  35.57 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  37.9 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  32.46 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  31.16 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>