204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2198 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  55.13 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  57.45 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  52.48 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  49.37 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  49.37 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  49.37 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  51.85 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  47.26 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  46.94 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  47.33 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  47.26 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  44.83 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  43.92 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  45.21 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  43.48 
 
 		 151 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  44.3 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  44.14 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  46.94 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  45.8 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.8 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.26 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.26 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  38.03 
 
 		 183 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  44.55 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  35.11 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.23 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  35.29 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.1 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.39 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  35.61 
 
 		 167 aa  84  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  36.76 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  33.85 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  40.57 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  36.84 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  37.74 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  38.62 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  39.06 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.9 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  44.12 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.09 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.83 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.25 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.54 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  33.57 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  39.05 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  43.56 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  34.92 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  34.33 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  33.82 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.89 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  43.56 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  36.79 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  34.35 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.91 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.2 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  34.88 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  35.34 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  36.36 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.37 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  32.39 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  33.81 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  36.8 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.35 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  31.3 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.51 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  37.23 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  38.24 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  38.46 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  29.86 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  39.39 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  31.47 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  32.87 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.6 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  28.57 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  33.98 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  37.82 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  36.7 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  29.14 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  31.86 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  32.41 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>