206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1087 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
144 aa  295  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  51.91 
 
 
141 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  46.56 
 
 
145 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  42.06 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  47.15 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  42.06 
 
 
140 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  42.28 
 
 
138 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  47.32 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.48 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  47.22 
 
 
127 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  43.8 
 
 
311 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  47.22 
 
 
127 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  39.84 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  43.08 
 
 
385 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  41.6 
 
 
131 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  44.35 
 
 
271 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  42.86 
 
 
332 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  44.64 
 
 
127 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.93 
 
 
138 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40.15 
 
 
143 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40.15 
 
 
143 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  42.64 
 
 
150 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  42.74 
 
 
265 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  33.87 
 
 
323 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  46.32 
 
 
123 aa  94  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.3 
 
 
162 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  34.92 
 
 
178 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  34.92 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  91.3  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.12 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  34.13 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  39.04 
 
 
173 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.4 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  34.92 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.65 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  35.94 
 
 
155 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  33.06 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 
205 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  36.67 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  35.53 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  38.24 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  31.54 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.51 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.07 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  33.07 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  34.17 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  37.78 
 
 
160 aa  76.6  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  35 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  40.95 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  33.85 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  35.51 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  30.3 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  36.84 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  40.95 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.97 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  34.17 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  37.21 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  36.97 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  29.92 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.83 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.09 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  37.37 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.38 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  34.81 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  31.82 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  30.61 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  37.37 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  30.47 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  36.8 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  35.11 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  36.61 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  35.96 
 
 
321 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.41 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  34.11 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  32.09 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  37.11 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>