206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1984 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  76.22 
 
 		 182 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  61.96 
 
 		 163 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  59.76 
 
 		 174 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  54.6 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  53.02 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  53.25 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  58.45 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  54.73 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  54.67 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  53.85 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  53.19 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  48.28 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  49.31 
 
 		 162 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  47.3 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  46.9 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  47.3 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  44.9 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  45.21 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  47.46 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.44 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  43.09 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  97.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  97.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 		 135 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  37.29 
 
 		 151 aa  87.8  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  40 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  36.17 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  37.9 
 
 		 332 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  37.1 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.82 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.09 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  44.17 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.33 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  36.67 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.9 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.61 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  40.34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.68 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.21 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.17 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  36.8 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  37.7 
 
 		 272 aa  77.8  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.89 
 
 		 324 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  40.31 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.29 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.82 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.59 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  40.86 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  38.71 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  38.39 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.13 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  34.92 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.3 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.84 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  28.46 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  35.83 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  28.46 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  40.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  32.71 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  28.46 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  33.68 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.86 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  37.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.3 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  28.32 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  37.11 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  31.62 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.74 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  37.11 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  34.75 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  37.27 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  34.68 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  38.95 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  38.95 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  32.62 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>