208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1820 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  46.97 
 
 
144 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  44.78 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  39.13 
 
 
145 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  42.65 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.85 
 
 
143 aa  97.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.85 
 
 
143 aa  97.4  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  39.55 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  41.98 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  47.75 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.35 
 
 
205 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  35.88 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.43 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.7 
 
 
151 aa  88.2  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  88.2  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  44.55 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  41.22 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  43.7 
 
 
294 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  39.52 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.87 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  40.15 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  45.54 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  38.64 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35.04 
 
 
183 aa  84  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  41.96 
 
 
165 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  35.94 
 
 
166 aa  84  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  37.89 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  41.35 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  37.69 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.42 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  40.94 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  37.12 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.35 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  43.56 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  42.31 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  41.73 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  37.12 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  37.12 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  38.52 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.61 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  35.77 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  39.42 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 
271 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  37.01 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  33.81 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  37.69 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  38.4 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.01 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  37.12 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  33.56 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  39.37 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.01 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  34.09 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  40.18 
 
 
178 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  35.51 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  43.3 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  38.76 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  37.5 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  37.11 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  35.66 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  40.3 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  38.3 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  42.37 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  34.78 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  34.15 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  34.78 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.8 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.21 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  39.02 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  42.57 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  42.55 
 
 
324 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  42 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.34 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  36.5 
 
 
235 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  41.9 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.38 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  35.51 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  32.58 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  35.51 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  35.51 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>