208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0796 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  286  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  46.97 
 
 
162 aa  111  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  50.39 
 
 
147 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.52 
 
 
160 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  43.65 
 
 
135 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  45.99 
 
 
147 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35.82 
 
 
183 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40.8 
 
 
151 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  36.24 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  37.88 
 
 
181 aa  95.9  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40.62 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.09 
 
 
294 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  35.66 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.72 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  40.31 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  41.84 
 
 
167 aa  92  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  34.31 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  45.16 
 
 
182 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.27 
 
 
155 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  46.91 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  36.22 
 
 
129 aa  90.5  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.88 
 
 
183 aa  90.1  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  48.15 
 
 
172 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  49 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  46.91 
 
 
196 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  38.06 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  36.22 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  47.31 
 
 
143 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  47.31 
 
 
143 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 
283 aa  85.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  38.28 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  34.51 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  45 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  40.15 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  38.64 
 
 
157 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35.62 
 
 
180 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  41.05 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  38.64 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  38.64 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 
205 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  34.82 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  33.78 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  35.54 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  38.64 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.96 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  48.28 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  35.94 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  42.5 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  41.67 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  39.42 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  36.03 
 
 
251 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  39.68 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  35.82 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  36.3 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  35.33 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.07 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  37.23 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  38.17 
 
 
248 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  37.11 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  33.06 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  27.97 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  37.3 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  39.36 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  37.38 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.01 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  33.33 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  31.25 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  31.25 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.59 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.78 
 
 
311 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  36.64 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  28.06 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  36.15 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  34.33 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  34.81 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  35.42 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.81 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  34.56 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  36.36 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  43.62 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  43.62 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  45.74 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>