207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0709 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  98.81 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  91.02 
 
 		 167 aa  309  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  71.97 
 
 		 162 aa  236  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  69.57 
 
 		 165 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  67.52 
 
 		 162 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  59.15 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  53.79 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  48.39 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  49.37 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  50.7 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  47.92 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  50.69 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  48.61 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  49.31 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  48.91 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  51.09 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  47.02 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  47.33 
 
 		 151 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  49.61 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  47.3 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.51 
 
 		 143 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.51 
 
 		 143 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  42.74 
 
 		 151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.64 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.35 
 
 		 138 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.48 
 
 		 311 aa  104  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.9 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.15 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  51.89 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  38.64 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  33.81 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.23 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  42.02 
 
 		 131 aa  94.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  38.58 
 
 		 332 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.23 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.92 
 
 		 144 aa  92  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  41.94 
 
 		 145 aa  91.3  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.92 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.38 
 
 		 241 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  41.73 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  40.15 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  39.62 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  36.72 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.06 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  34.27 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  36.54 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.66 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.13 
 
 		 323 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.8 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.22 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  37.27 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  36.59 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  33.07 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  47.06 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.51 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  33.08 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  30.53 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  34.56 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  35.58 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.51 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.19 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  38.02 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  42.16 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  33.83 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.37 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  29.17 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  32 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  34.13 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  37.24 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  34.25 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  34.93 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  35.62 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  34.64 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  34.64 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  32.46 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  34.64 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  34.64 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.82 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  34.25 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>