208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1581 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  66.15 
 
 
129 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  59.52 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  46.09 
 
 
162 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.39 
 
 
167 aa  97.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40.6 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.24 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  42.28 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  43.75 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  41.98 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  41.22 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40.74 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  36.92 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36.92 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.39 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.98 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  44.7 
 
 
131 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  40.91 
 
 
131 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  41.94 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  45.1 
 
 
294 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  37.96 
 
 
175 aa  90.5  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  41.94 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  41.59 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  42.31 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.43 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.71 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.57 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  36.17 
 
 
145 aa  84.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.68 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  36.5 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.77 
 
 
271 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.07 
 
 
237 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  35.88 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  37.31 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.74 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.01 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  38.76 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  35.07 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  39.53 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  44.12 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  32.58 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  39.02 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.66 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.97 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  33.56 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  36.5 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  34.31 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.66 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  31.88 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.21 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  36.51 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  34.87 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  31.58 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  39.33 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  34.21 
 
 
385 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  30.71 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  37.17 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  38.89 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  36.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  33.59 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  34.06 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  34.31 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  37.4 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  36.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  36.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  36.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  37.41 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  33.07 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  39.58 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  35.46 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  35.29 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  38.74 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  38.66 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  37.39 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  35.29 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  38.66 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  34.56 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  38 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.3 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  39.02 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  33.79 
 
 
248 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  34.56 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  32.09 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.56 
 
 
230 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>