206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4260 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  336  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  55.41 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  51.9 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  53.8 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  51.52 
 
 		 294 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  47.59 
 
 		 183 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  49.68 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  46.15 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  43.4 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  46.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  44.79 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  47.71 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  47.48 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  40.91 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  43.62 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.53 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.53 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  43.28 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40.48 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.57 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  39.07 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  45.71 
 
 		 231 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  43.36 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  41.84 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  43.65 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  40.54 
 
 		 251 aa  94.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40.38 
 
 		 237 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 231 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  41.5 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  45.45 
 
 		 230 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  43.94 
 
 		 234 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  41.91 
 
 		 235 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  39.69 
 
 		 139 aa  90.5  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  44.7 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  44.7 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.22 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  39.52 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  40.8 
 
 		 142 aa  85.1  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  40.3 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.87 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  40.29 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  35.44 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.44 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.12 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.24 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.31 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  35.53 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  35.88 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  36.84 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  40.44 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  37.97 
 
 		 245 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.61 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.01 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  33.77 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.72 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  38.64 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  35.88 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  35.07 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  35.53 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  35.66 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  35.25 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  34.03 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  34.44 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  41.96 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  34.81 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  35.86 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  36.81 
 
 		 244 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  34.81 
 
 		 256 aa  72  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  36.11 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  34.72 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  34.72 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  36.3 
 
 		 244 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>