208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1968 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  53.55 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  52.86 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  47.18 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  47.3 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  46.9 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  46.94 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  47.86 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  47.86 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  50.36 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  40.26 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.56 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  42.58 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  46.88 
 
 		 294 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.31 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  44.2 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  39.04 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.54 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.31 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  43.26 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  36.99 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  44.2 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  42.54 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  44 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  39.23 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  42.54 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  39.19 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35.57 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  42.45 
 
 		 232 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.12 
 
 		 311 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.92 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  42.45 
 
 		 230 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  40.48 
 
 		 138 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  40.97 
 
 		 239 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  38.67 
 
 		 235 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  42.27 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  41.1 
 
 		 231 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  32.89 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  41.73 
 
 		 230 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  41.73 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  39.49 
 
 		 248 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  32.89 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.26 
 
 		 231 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  39.87 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  39.16 
 
 		 240 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  35.26 
 
 		 240 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  36.42 
 
 		 233 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  39.86 
 
 		 251 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  32.21 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.06 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  36.94 
 
 		 232 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.93 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40.29 
 
 		 234 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  36.49 
 
 		 238 aa  84.3  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.94 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  40.14 
 
 		 251 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  31.76 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  36.6 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  37.25 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  33.57 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  37.41 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  38.35 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  46.53 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  39.33 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  33.08 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  35.57 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  31.87 
 
 		 238 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  33.08 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  37.18 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  36.6 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  32 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  34.75 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  41 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  39.17 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  39.19 
 
 		 262 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35.88 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  42.98 
 
 		 244 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  31.65 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  34.23 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  37.41 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  35.85 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  35.54 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>