208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1388 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  93.48 
 
 		 239 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  84.78 
 
 		 235 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  80.87 
 
 		 230 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  82.46 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  81.06 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  79.13 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  79.57 
 
 		 232 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  76.96 
 
 		 240 aa  363  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  75.33 
 
 		 231 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  75.33 
 
 		 231 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  51.07 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  52.02 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  49.78 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  47.37 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  50.23 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  46.12 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  48.07 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  49.31 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  46.54 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  46.98 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  49.57 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  49.11 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  46.58 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  45.16 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  47.73 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  47.96 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  47.96 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  50.93 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  46.22 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  47.27 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  47.27 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  45.76 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  46.36 
 
 		 244 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  47.51 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  47.51 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  46.67 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  48.48 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  47.03 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  47.03 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  45.78 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  47.03 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  40.17 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  46.12 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  48.6 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  47.2 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  46.48 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  45.87 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  40.26 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  41.77 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  42.66 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  40.35 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  35.19 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  151  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  37.95 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  46.15 
 
 		 142 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  34.1 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  44.97 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  43.62 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  43.54 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  45.58 
 
 		 182 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40.58 
 
 		 135 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  43.15 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  41.79 
 
 		 164 aa  97.1  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  43.8 
 
 		 160 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  37.76 
 
 		 163 aa  95.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  38.51 
 
 		 286 aa  95.1  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  40.12 
 
 		 294 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  40.85 
 
 		 183 aa  91.7  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  36.91 
 
 		 166 aa  91.7  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  37.67 
 
 		 166 aa  91.7  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.55 
 
 		 145 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  35.63 
 
 		 166 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.48 
 
 		 155 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  42.65 
 
 		 175 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.87 
 
 		 155 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  41.3 
 
 		 161 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  38.21 
 
 		 161 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.42 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  40.77 
 
 		 171 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.24 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>