200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1915 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  52.94 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  50.98 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  45.78 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  46.19 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  43.32 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  45.74 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  45.74 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  44.07 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  44.93 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  46.86 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  46.67 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  43.4 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  41.06 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  46.41 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  42.24 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40.51 
 
 		 237 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  41.95 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  42.19 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  41.28 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  43.61 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  39.08 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  40.99 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  44.33 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  37.6 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  37.85 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  37.65 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.04 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  41.08 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  39.41 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  38.87 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.15 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  37.7 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  38.98 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  37.71 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  37.71 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  37.71 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  37.71 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  37.71 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.55 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  38.82 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  38.56 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  41.43 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  40.81 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  38.02 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  42.31 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  36.73 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  37.65 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  39.42 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  38.33 
 
 		 234 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  35.17 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  35.32 
 
 		 231 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  37.95 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  35.44 
 
 		 228 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  37.93 
 
 		 233 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  37.27 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  37.27 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  36.94 
 
 		 336 aa  99  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  36.31 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  34.59 
 
 		 172 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  38 
 
 		 142 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  32.77 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.07 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.32 
 
 		 183 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  32.2 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  31.61 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  33.13 
 
 		 167 aa  72  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  47.67 
 
 		 161 aa  72  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  35.65 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  39.45 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  35.77 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  36.6 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  36.28 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  33.55 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  33.76 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  35.85 
 
 		 133 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  30.72 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  31.76 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  29.77 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  58.49 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  36.04 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  31.06 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  31.37 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>