205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2589 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  73.62 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  76.6 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  74.58 
 
 		 256 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  75 
 
 		 244 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  74.22 
 
 		 244 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  74.12 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  73.21 
 
 		 244 aa  341  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  72.81 
 
 		 244 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  69.07 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  68.88 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  68.88 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  68.88 
 
 		 244 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  68.88 
 
 		 244 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  70.46 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  68.78 
 
 		 265 aa  331  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  55.51 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  51.08 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  51.08 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  51.08 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  51.08 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  51.08 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  52.4 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  49.79 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  49.78 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  50.22 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  47.28 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  50.22 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  48.9 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  50.7 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  49.33 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  48.46 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  48.84 
 
 		 235 aa  224  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  51.6 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  45.49 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  47.91 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  47.91 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  51.61 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  47.91 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  49.77 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  49.32 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  49.09 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  46.72 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  45.05 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  46.7 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  46.72 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  47.37 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  47.6 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  46.7 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  44.49 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  48.64 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  47.27 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.02 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  44.09 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  46.15 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  43.1 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  46.02 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  44.55 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.13 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  43.69 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  36.22 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  44.33 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  36.84 
 
 		 280 aa  151  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  42.04 
 
 		 172 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  40.52 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.52 
 
 		 172 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  37.27 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.52 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  41.96 
 
 		 142 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.67 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  40.56 
 
 		 183 aa  96.3  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  32.52 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  38.89 
 
 		 164 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  41.26 
 
 		 163 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  39.71 
 
 		 162 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  38.41 
 
 		 175 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  42.03 
 
 		 160 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36.18 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  34.48 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  35.92 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.49 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.57 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  37.58 
 
 		 183 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  34.33 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.52 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  30.67 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.16 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  34.4 
 
 		 160 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  35.06 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>