213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1330 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  47.53 
 
 
161 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  37.18 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  37.06 
 
 
183 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.23 
 
 
294 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.42 
 
 
166 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.31 
 
 
183 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  40.14 
 
 
162 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  104  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  38.85 
 
 
166 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.86 
 
 
160 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
171 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  39.86 
 
 
175 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  39.31 
 
 
164 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  101  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  36.55 
 
 
155 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  39.72 
 
 
162 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  43.41 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.78 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.42 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  38.41 
 
 
162 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.6 
 
 
311 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.64 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  34.16 
 
 
235 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.73 
 
 
145 aa  92  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  34.16 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  34.16 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  34.06 
 
 
167 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  35.06 
 
 
235 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.8 
 
 
163 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  34.97 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  38.35 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  41.25 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  35.62 
 
 
234 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  34.44 
 
 
167 aa  88.6  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  34.16 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  33.52 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  34.85 
 
 
145 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  34.09 
 
 
165 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.48 
 
 
238 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  36.54 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  38.06 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  35.88 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  33.57 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  35.26 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  35.44 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.84 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.73 
 
 
235 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  35.88 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 
144 aa  82  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  33.75 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  37.58 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  37.98 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  30.38 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  30.38 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  36.75 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.22 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  30.38 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  35.62 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  34.1 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  30.38 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  33.12 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  35.81 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  30.38 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  35.37 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  35.48 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  31.97 
 
 
150 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  33.11 
 
 
262 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  41.05 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.25 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  31.28 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  37.04 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  31.01 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  31.01 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  29.75 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  35.04 
 
 
152 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  33.75 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  34.62 
 
 
131 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  31.82 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  30.32 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  34.96 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  33.12 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  33.83 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  31.64 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  34.78 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35.17 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  35.16 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  30.38 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>