208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5324 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  85.19 
 
 		 162 aa  283  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  70.51 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  67.52 
 
 		 167 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  67.52 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  67.52 
 
 		 178 aa  223  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  57.25 
 
 		 176 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  57.45 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  53.15 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  49.65 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  48.28 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  48.92 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  48.61 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  48.61 
 
 		 174 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  45.14 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  48.55 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  48.51 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  47.22 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  43.79 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  47.83 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  43.67 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  44.9 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  45.07 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.88 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  43.31 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.84 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.69 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  47.76 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.03 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  44.03 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.54 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.81 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  40.88 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  96.3  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 		 294 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  42.28 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  40.88 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.37 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  41.04 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  42.45 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.41 
 
 		 205 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  35.86 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.29 
 
 		 311 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  47.66 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.56 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  43.48 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  37.7 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  37.31 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  39.1 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  37.68 
 
 		 332 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  36.22 
 
 		 129 aa  85.1  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  40.3 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  37.4 
 
 		 272 aa  84.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  84.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.61 
 
 		 241 aa  84  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  39.34 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  32.35 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  37.4 
 
 		 323 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  38.84 
 
 		 324 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  46.23 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.81 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.4 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  36.44 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  39.42 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  37.76 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.46 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  34.75 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  38.19 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  38.76 
 
 		 332 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.07 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  37.04 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  41.96 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  42.59 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  39.18 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.33 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  34.51 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.3 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  41.59 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  37.17 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  35.42 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  35.66 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  34.46 
 
 		 238 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  37.14 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  35.85 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  36.99 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>