206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2599 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
158 aa  328  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  60.13 
 
 
158 aa  216  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  46.5 
 
 
162 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  43.71 
 
 
160 aa  157  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  43.66 
 
 
321 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.3 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  39.62 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  39.62 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  37.74 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  37.61 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  39.81 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  37.74 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  40.57 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  37.39 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  37.39 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  34.4 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  37.14 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.94 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  33.6 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  38.89 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  35.85 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  33.96 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  37.74 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  35.85 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  31.93 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  37.38 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  32.08 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  31.67 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  36.59 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  36.79 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.04 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  31.91 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  32.73 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  33.93 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.25 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.61 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  31.82 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  33.6 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.63 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  34.03 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  32.08 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  28.48 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  30.16 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  32.03 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  37.5 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  39.58 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  39.58 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  39.58 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  39.58 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  39.58 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  34.86 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  33.02 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  36.46 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  32.41 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  33.96 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  30.99 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  30 
 
 
283 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  33.02 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  27.48 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  30.56 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  33.96 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.02 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  33.93 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  30.85 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  30 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  35.42 
 
 
235 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  35.78 
 
 
233 aa  62  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  32.23 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  24.79 
 
 
181 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  33.65 
 
 
240 aa  61.2  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  32.23 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>