More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3569 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  64.46 
 
 
332 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  56.53 
 
 
385 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  46.58 
 
 
324 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  43.81 
 
 
323 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  48.35 
 
 
213 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  55.2 
 
 
140 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  54.92 
 
 
138 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  55.2 
 
 
140 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  52.8 
 
 
138 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  45.9 
 
 
131 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  46.03 
 
 
131 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.15 
 
 
144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  41.18 
 
 
123 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  35 
 
 
243 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  35 
 
 
231 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32.58 
 
 
210 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.24 
 
 
145 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  33.9 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  34.78 
 
 
127 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  34.91 
 
 
218 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 
168 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 
167 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  44 
 
 
272 aa  92.8  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  38.58 
 
 
178 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  34.32 
 
 
218 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  40.34 
 
 
141 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.68 
 
 
271 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  32.8 
 
 
214 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.77 
 
 
222 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.38 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  41.8 
 
 
143 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  41.8 
 
 
143 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  32.95 
 
 
215 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
215 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  32.57 
 
 
210 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  41.41 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  36.26 
 
 
208 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  36.26 
 
 
208 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  35.36 
 
 
226 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  34.34 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  32.95 
 
 
210 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  34.91 
 
 
210 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.23 
 
 
181 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  33.33 
 
 
220 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.71 
 
 
225 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  39.85 
 
 
176 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 
162 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.68 
 
 
162 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  40.83 
 
 
138 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  39.02 
 
 
151 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  32.22 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  37.9 
 
 
164 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  29.07 
 
 
190 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  32.75 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  32.78 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  29.07 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 
239 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  37.3 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.59 
 
 
166 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.21 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  35.67 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.62 
 
 
151 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  36.29 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  36.43 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  32.77 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  27.91 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  35.16 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  35.11 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.57 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  32.16 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.53 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  39.17 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  44.19 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  28.49 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.22 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.22 
 
 
204 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  32.57 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  32.76 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36.11 
 
 
166 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  31.49 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  31.11 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  32.43 
 
 
218 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  40.77 
 
 
175 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  31.11 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35.04 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>