208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4759 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  72.19 
 
 		 153 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  69.54 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  61.88 
 
 		 163 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  68.87 
 
 		 153 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  63.12 
 
 		 163 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  59.01 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  69.93 
 
 		 153 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  61.21 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  57.79 
 
 		 182 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  66.9 
 
 		 176 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  55.17 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  60.43 
 
 		 153 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  53.25 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  59.03 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  54.48 
 
 		 168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  53.79 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  50.34 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  48.28 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  47.33 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  50.42 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45.74 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  42.5 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.03 
 
 		 241 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.97 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  42.02 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.34 
 
 		 311 aa  88.2  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.06 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  87  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.09 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 		 233 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  38.69 
 
 		 233 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  40.8 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.01 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  40.16 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  39.26 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  37.3 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  37.14 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.28 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  35.43 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.43 
 
 		 323 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  34.09 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  34.17 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  39.1 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  37.11 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  42.15 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  36.46 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  36.46 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  38.78 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  38.78 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.94 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  37.66 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  33.82 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  43 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  36.46 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  37.3 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  43.16 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.02 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  36.3 
 
 		 385 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  35.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.88 
 
 		 271 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  32.38 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.66 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  44.21 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.69 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  33.08 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  30 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>