206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4390 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  64.79 
 
 
153 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  66.9 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  64.79 
 
 
145 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  55.35 
 
 
182 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  59.57 
 
 
162 aa  171  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  59.12 
 
 
165 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  56.03 
 
 
167 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  57.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  58.16 
 
 
174 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  56.74 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  59.15 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  56.74 
 
 
163 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  56.83 
 
 
163 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  60.28 
 
 
153 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  53.19 
 
 
173 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  61.87 
 
 
153 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  58.57 
 
 
153 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  57.55 
 
 
153 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  53.19 
 
 
164 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  46.94 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.07 
 
 
143 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.07 
 
 
143 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  40.68 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  47.24 
 
 
241 aa  91.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  41.46 
 
 
131 aa  92  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  42.02 
 
 
151 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.5 
 
 
167 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.44 
 
 
138 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  40.83 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  39.85 
 
 
332 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  85.1  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.44 
 
 
294 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  40.5 
 
 
138 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.44 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  40.15 
 
 
385 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  30.51 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.14 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  38.14 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  27.97 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.33 
 
 
311 aa  77.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.75 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  35.83 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  43.69 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.52 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.13 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  33.05 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.32 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  37.8 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  38.33 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  30.51 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  39.78 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.16 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  33.87 
 
 
129 aa  72  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  33.88 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  37.37 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  32.54 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.23 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.19 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.58 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  36.29 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.05 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  35.35 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  32.2 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  36.67 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  34.92 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.43 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  34.38 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  28.57 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  29.81 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  36.29 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  34.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  34.13 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.13 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  33.59 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  34.92 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.89 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  33.59 
 
 
238 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  31.45 
 
 
232 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.54 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  36.72 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  30.68 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  32.95 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  30.3 
 
 
127 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>