208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1839 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  66.15 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  55.12 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  42.75 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 294 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  39.23 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.22 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  38.93 
 
 		 183 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  37.21 
 
 		 181 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  42.2 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  36 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.4 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.88 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  36 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  39.06 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  40.74 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  39.37 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  36.22 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  43 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  38.6 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  38.93 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  37.6 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.09 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.98 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  33.07 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  33.07 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.35 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  39.1 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.97 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  36.96 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  33.87 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  42.05 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  34.62 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.38 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  32.03 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.35 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  42.05 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  31.2 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  41.38 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  33.87 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  41.27 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  33.59 
 
 		 271 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  34.67 
 
 		 182 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.09 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  37.27 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  31.54 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  35.66 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.76 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  35.56 
 
 		 241 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.11 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  34.38 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  37.76 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  32.59 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  38.94 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  41.94 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  33.61 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  35.77 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  30.07 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  31.07 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  35.16 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  35.38 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.23 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  33.09 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  33.58 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  36.94 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  31.01 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  33.09 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  33.88 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  39.33 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  33.58 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  34 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  32.39 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  41.05 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  36.21 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.18 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  32.84 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  33.58 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  35.34 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>