212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0760 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  85.33 
 
 		 153 aa  269  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  40.29 
 
 		 160 aa  106  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  39.57 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  39.29 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  38.57 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  42.03 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  45.95 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  44.2 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  41.8 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  35.51 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  39.84 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  44.34 
 
 		 180 aa  97.1  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  41.07 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  41.07 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  44.34 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  38.85 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  38.28 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  38.41 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  40.38 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  39.37 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  35.57 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  42.31 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.41 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  37.9 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  44.23 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  48.08 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  43.86 
 
 		 272 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.18 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  35.88 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  43.59 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.73 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  48.08 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  41.09 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.68 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.62 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  39.25 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  47.06 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  45.26 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  37.6 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  38.76 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.65 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 		 271 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  37.69 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  41.46 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  36.81 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  42.59 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  32.43 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.92 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  38.71 
 
 		 324 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.6 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  39.81 
 
 		 240 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.59 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.66 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  34.53 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  34.53 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  43.88 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  34.53 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  34.53 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  32.65 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  34.53 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  33.8 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  43.56 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  36.5 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  33.8 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.37 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  34.11 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.29 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.29 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>