208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1495 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  85.71 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  84.83 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  37.24 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  36.73 
 
 		 160 aa  95.9  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  40.8 
 
 		 182 aa  95.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  40.3 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  38.28 
 
 		 150 aa  94  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  44.12 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  42.31 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.01 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.21 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  38.36 
 
 		 180 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.01 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  90.5  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  36.07 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.76 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  41.94 
 
 		 294 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.09 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  31.03 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  34.43 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.19 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  34.43 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  34.43 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  39.84 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.32 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  40.83 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  44.12 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  45.26 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  37.88 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.25 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  35.88 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  35.21 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  36.3 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  33.09 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.48 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  40.18 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  37.21 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  37.86 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.17 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.21 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  41.12 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  41.12 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  36.92 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  34.07 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  34.69 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  40.82 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  37.21 
 
 		 244 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  32.86 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  43.62 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.1 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  39.53 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  35.24 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  36.99 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.51 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  32.59 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  46.15 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.04 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>