208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0453 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  69.23 
 
 		 162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  69.57 
 
 		 178 aa  231  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  71.79 
 
 		 168 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  68.55 
 
 		 167 aa  230  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  70.51 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  59.12 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  52.48 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  52.17 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  51.77 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  49.64 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  47.59 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  51.94 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  46.1 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  48.85 
 
 		 151 aa  134  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  48.18 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  47.52 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  48.28 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  48.18 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  47.65 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.27 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.27 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  43.18 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  39.53 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.98 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.23 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  42.06 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.8 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  46.22 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.77 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.97 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  42.57 
 
 		 241 aa  94  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.04 
 
 		 311 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  41.22 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  38.68 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  41.59 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.06 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  38.4 
 
 		 131 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  37.96 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  49.02 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  39.84 
 
 		 272 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.09 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.88 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  42.24 
 
 		 142 aa  85.1  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  35.25 
 
 		 294 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  44.95 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.35 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.96 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  48.08 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  36.61 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  36.42 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  38.24 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.67 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  37.82 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.59 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  38.46 
 
 		 385 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  36.43 
 
 		 332 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.16 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.87 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.61 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  36.23 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.58 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  43.4 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  37.17 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  35.51 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.55 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  39.67 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.63 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  39.64 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.13 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  42.72 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  39.42 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  38.84 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  41.24 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  38.14 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.9 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  34.69 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  34.9 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>