207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2362 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  100 
 
 
237 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  50.43 
 
 
231 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  48.7 
 
 
234 aa  245  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  48.7 
 
 
240 aa  240  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  49.57 
 
 
235 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  49.57 
 
 
235 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  49.57 
 
 
235 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  51.11 
 
 
235 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  48.5 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  50.21 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  48.75 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  50.44 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  48.92 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  45.57 
 
 
232 aa  230  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  50.44 
 
 
235 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  52.34 
 
 
248 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  48.23 
 
 
235 aa  228  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  48.67 
 
 
235 aa  228  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  46.78 
 
 
239 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  48.67 
 
 
235 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  47.44 
 
 
240 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  49.56 
 
 
235 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  44.92 
 
 
251 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  45.49 
 
 
245 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  48.92 
 
 
228 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  44.29 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  47.62 
 
 
245 aa  218  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  47.64 
 
 
265 aa  218  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  48.1 
 
 
233 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  49.35 
 
 
241 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  47.41 
 
 
244 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  47.46 
 
 
233 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  47.41 
 
 
244 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  46.52 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  45.22 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  52.47 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  46.98 
 
 
244 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  46.98 
 
 
244 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  49.07 
 
 
244 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  52.04 
 
 
231 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  47.01 
 
 
244 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  52.04 
 
 
231 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  48.4 
 
 
244 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  46.55 
 
 
244 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  49.09 
 
 
235 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  51.8 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  47.47 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  46.64 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  49.11 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  49.55 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  48.66 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  49.11 
 
 
230 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  48.66 
 
 
230 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  47.77 
 
 
232 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  39.04 
 
 
280 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  40.51 
 
 
263 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.22 
 
 
231 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  37.17 
 
 
239 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  37.3 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  50.91 
 
 
172 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  50.62 
 
 
196 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  53.8 
 
 
182 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  52.83 
 
 
172 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  32.95 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  45.45 
 
 
142 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  44.51 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  46.21 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
164 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.41 
 
 
167 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  43.07 
 
 
162 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.02 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.27 
 
 
164 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  38.99 
 
 
163 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  40.38 
 
 
166 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40.58 
 
 
135 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  42.04 
 
 
166 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.8 
 
 
167 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  38.18 
 
 
175 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  44.83 
 
 
145 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  39.07 
 
 
166 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  43.23 
 
 
161 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  32.39 
 
 
181 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.44 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>