208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0340 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  290  7e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  51.45 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  53.38 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  53.38 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  54.14 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  51.94 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  49.62 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  44.78 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  50 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  48.51 
 
 		 162 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  45.74 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  49.61 
 
 		 178 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  49.61 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  47.37 
 
 		 311 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  46.85 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  47.29 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  46.56 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  45.07 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  45.26 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  47.18 
 
 		 164 aa  116  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  50.42 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  47.11 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  43.51 
 
 		 173 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.54 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  43.17 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  41.79 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  45.74 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  46.43 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  41.55 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  41.26 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  44.92 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  43.28 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  47.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  41.1 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  43.44 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  45.32 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  45 
 
 		 272 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  43.22 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  42.37 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  45.6 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  43.8 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  42.96 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  41.53 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  38.3 
 
 		 163 aa  100  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  42.45 
 
 		 294 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  42.07 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  47.66 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 		 196 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 		 172 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  44.2 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  43.75 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  38.56 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  40.27 
 
 		 251 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  38.16 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  41.55 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  47.24 
 
 		 332 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.14 
 
 		 240 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  41.73 
 
 		 323 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  38.16 
 
 		 235 aa  94.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  41.96 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  40.41 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  43.26 
 
 		 239 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  40.31 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  47.2 
 
 		 385 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  40.68 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.73 
 
 		 205 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  40.74 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  45.63 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 235 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  40.14 
 
 		 262 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  36.55 
 
 		 238 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  44.23 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.33 
 
 		 231 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  42.55 
 
 		 230 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  44.83 
 
 		 237 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40.6 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  40.52 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  34.06 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  42.42 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  42.14 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>