208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3550 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  84.97 
 
 		 153 aa  265  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  84.31 
 
 		 153 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  75.86 
 
 		 153 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  68.71 
 
 		 163 aa  214  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  68.87 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  67.35 
 
 		 173 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  61.84 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  62.67 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  60.27 
 
 		 182 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  58.7 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  56.43 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  54.73 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  57.55 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  48.61 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  49.31 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  47.59 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  48.55 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  48.55 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  44.83 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  42.98 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.53 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  44.92 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  45 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  39.83 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  37.19 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  44.54 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  33.9 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.66 
 
 		 311 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  42.34 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  38.21 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.7 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  42.54 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.1 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  32.77 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.1 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  41.46 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.98 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  35.83 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  34.43 
 
 		 272 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  39.17 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  41.46 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  42 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  43.68 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.17 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.93 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.82 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.15 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.45 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  35.61 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  36.59 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  34.17 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36.64 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.17 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  33.61 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  37.21 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  35.29 
 
 		 323 aa  70.5  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  33.68 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  35.35 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  38.93 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  38.17 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  42.06 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  45.65 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  33.83 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  35.87 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  36.09 
 
 		 231 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  35.35 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.72 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>